Es una red ecológica europea de áreas de conservación de la biodiversidad. Consta de Zonas Especiales de Conservación (ZEC) establecidas de acuerdo con la Directiva Hábitat y de Zonas de Especial Protección para las Aves (ZEPA) designadas según la Directiva Aves.
En la Comunidad de Villa y Tierra de Sepúlveda están presentes los espacios naturales Red Natura 2000:
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- ZEC Sierra Pradales
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- ZEC Riberas Río Duratón
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- ZEC Sierra Ayllón
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- ZEC Sabinares Somosierra
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- ZEC y ZEPA Lagunas Cantalejo
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- ZEC y ZEPA Hoces Duratón
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- ZEC y ZEPA Sierra Guadarrama
Destaca por su estado de conservación la presencia de Águila Imperial Ibérica (Aquila adalberti) en el ZEC y ZEPA Sierra de Guadarrama y de Cigüeña negra (Ciconia nigra) en el ZEC y ZEPA Lagunas de Cantalejo.
Son numerosas las sendas que están señalizadas en estos espacios naturales y que permiten la visita in situ de estos territorios con gran valor medioambiental. A su vez, en las lagunas de Cantalejo, existen varios observatorios de aves migratorias.